حجج الاسلام مصطفی جمالی، سیدپیمان غنایی، علی محمدی، حسن شیخ العراقین زاده و جناب آقای مجتبی سرفراز کسانی هستند که به حکم ریاست محترم فرهنگستان علوم اسلامی قم، حجت الاسلام و المسلمین سیدمحمدمهدی میرباقری، به عضویت هیأت مدیره این سازمان درآمده اند.
اهم وظایف هیأت مدیره عبارت است از:
- مسئول، برنامه ریزی، سازمان دهی، نظارت و ارزیابی نسبت به کلیه فعالیت ها و بخش های موسسه تحت اشراف ریاست می باشد.
1- حفظ پویایی ساختار سازمانی و استفاده از ظرفیت واقعی پژوهشگران و مدیران به گونه ای که کل سازمان در گسترش کل سازمان به شکل حداکثری به کار گرفته شود.
2- ایجاد نشاط، هم گرایی و اثر بخشی در فعالیت سازمان
3- پرورش نیروی انسانی نخبه و مدیر تحقیق در طراز فرهنگستان و مسلط بر منظومه فکری استاد علامه سید منیرالدین حسینی
4- استمرار و تقویت هدفمند پژوهش بنیادی و اتصال دادن آن به سه حوزه پژوهش حجیت، معادله و مدل برنامه در کشور
5- مشارکت حداکثری با افراد ، نهادها و مراکز مرتبط
6- مشارکت در پیشبرد جبهه فرهنگی انفلاب اسلامی
7- ایجاد شبکه نیروها از طریق موسسات اقماری به منظور استفاده اثربخش از تمامی ظرفیت ها و پی گیری و تحقق مطالبات رهبری در عین حفظ و ارتقاء هستمه مرکزی(فرهنگستان)
8- ارتقاء سطح فعالیت بانک اطلاعات به گونه ای توانا در ارائه خدمات پژوهشی به افراد درون و بیرون دفتر